Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCLP18206 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCLP18206 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCLP18206 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCLP18206 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCLP18206 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCLP18206 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCLP18206 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCLP18206 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCLP18206 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCLP18206 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCLP18206 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCLP18206 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCLP18206 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCLP18206 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCLP18206 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCLP18206 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VCLP18206 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCLP18206 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCLP18206 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCLP18206 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCLP18206 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCLP18206 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCLP18206 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCLP18206 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCLP18206 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCLP18206 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCLP18206 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VCLP18206 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VCLP18206 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCLP18206 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCLP18206 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCLP18206 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCLP18206 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCLP18206 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCLP18206 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCLP18206 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCLP18206 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCLP18206 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCLP18206 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCLP18206 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCLP18206 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCLP18206 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCLP18206 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCLP18206 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCLP18206 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCLP18206 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCLP18206 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCLP18206 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCLP18206 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCLP18206 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms