Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGFBP3P17936 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGFBP3P17936 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGFBP3P17936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGFBP3P17936 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms