Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFRAP16234 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDGFRAP16234 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFRAP16234 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRAP16234 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRAP16234 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms