Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2AFXP16104 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2AFXP16104 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFXP16104 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
H2AFXP16104 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms