Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDP15428 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDP15428 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPGDP15428 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPGDP15428 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPGDP15428 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPGDP15428 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPGDP15428 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPGDP15428 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDP15428 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDP15428 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPGDP15428 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDP15428 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDP15428 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDP15428 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPGDP15428 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPGDP15428 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPGDP15428 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPGDP15428 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPGDP15428 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPGDP15428 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPGDP15428 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPGDP15428 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPGDP15428 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPGDP15428 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPGDP15428 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPGDP15428 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPGDP15428 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPGDP15428 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPGDP15428 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPGDP15428 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPGDP15428 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPGDP15428 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPGDP15428 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPGDP15428 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPGDP15428 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPGDP15428 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPGDP15428 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPGDP15428 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPGDP15428 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPGDP15428 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPGDP15428 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPGDP15428 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPGDP15428 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPGDP15428 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPGDP15428 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms