Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL6A2P12110 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL6A2P12110 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL6A2P12110 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL6A2P12110 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL6A2P12110 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms