Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRFP11831 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRFP11831 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRFP11831 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRFP11831 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRFP11831 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRFP11831 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRFP11831 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRFP11831 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRFP11831 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRFP11831 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRFP11831 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRFP11831 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRFP11831 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRFP11831 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRFP11831 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRFP11831 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRFP11831 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRFP11831 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRFP11831 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRFP11831 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRFP11831 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRFP11831 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRFP11831 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRFP11831 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SRFP11831 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRFP11831 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRFP11831 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRFP11831 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRFP11831 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRFP11831 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRFP11831 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRFP11831 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRFP11831 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRFP11831 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRFP11831 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRFP11831 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRFP11831 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SRFP11831 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SRFP11831 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRFP11831 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRFP11831 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms