Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ESRRAP11474 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ESRRAP11474 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ESRRAP11474 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ESRRAP11474 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms