Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT16P08779 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT16P08779 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT16P08779 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT16P08779 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT16P08779 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT16P08779 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT16P08779 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT16P08779 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT16P08779 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT16P08779 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT16P08779 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT16P08779 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT16P08779 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT16P08779 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT16P08779 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT16P08779 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT16P08779 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT16P08779 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT16P08779 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT16P08779 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT16P08779 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT16P08779 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT16P08779 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT16P08779 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT16P08779 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT16P08779 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT16P08779 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT16P08779 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT16P08779 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT16P08779 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT16P08779 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT16P08779 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT16P08779 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT16P08779 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT16P08779 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT16P08779 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT16P08779 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT16P08779 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT16P08779 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT16P08779 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT16P08779 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT16P08779 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT16P08779 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT16P08779 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT16P08779 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT16P08779 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms