Protein–RNA interactions for Protein: P08243

ASNS, Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing], humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASNSP08243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ASNSP08243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ASNSP08243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ASNSP08243 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ASNSP08243 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ASNSP08243 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ASNSP08243 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ASNSP08243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ASNSP08243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASNSP08243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASNSP08243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASNSP08243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASNSP08243 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASNSP08243 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASNSP08243 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ASNSP08243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ASNSP08243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASNSP08243 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASNSP08243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASNSP08243 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ASNSP08243 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ASNSP08243 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ASNSP08243 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASNSP08243 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASNSP08243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASNSP08243 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASNSP08243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASNSP08243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ASNSP08243 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ASNSP08243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ASNSP08243 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASNSP08243 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASNSP08243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASNSP08243 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ASNSP08243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ASNSP08243 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ASNSP08243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASNSP08243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASNSP08243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ASNSP08243 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ASNSP08243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ASNSP08243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ASNSP08243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASNSP08243 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ASNSP08243 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASNSP08243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ASNSP08243 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASNSP08243 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ASNSP08243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASNSP08243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms