Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CST1P01037 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CST1P01037 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST1P01037 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST1P01037 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST1P01037 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST1P01037 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST1P01037 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST1P01037 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST1P01037 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CST1P01037 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST1P01037 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CST1P01037 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CST1P01037 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CST1P01037 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CST1P01037 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CST1P01037 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST1P01037 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST1P01037 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST1P01037 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST1P01037 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST1P01037 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST1P01037 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CST1P01037 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CST1P01037 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CST1P01037 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST1P01037 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST1P01037 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST1P01037 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST1P01037 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST1P01037 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST1P01037 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CST1P01037 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CST1P01037 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CST1P01037 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CST1P01037 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST1P01037 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CST1P01037 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CST1P01037 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CST1P01037 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CST1P01037 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST1P01037 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST1P01037 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST1P01037 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST1P01037 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST1P01037 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CST1P01037 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST1P01037 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST1P01037 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST1P01037 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST1P01037 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST1P01037 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST1P01037 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CST1P01037 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms