Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINC1P01008 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINC1P01008 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINC1P01008 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINC1P01008 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINC1P01008 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SERPINC1P01008 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SERPINC1P01008 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINC1P01008 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SERPINC1P01008 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms