Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPRP00739 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPRP00739 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPRP00739 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPRP00739 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPRP00739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPRP00739 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPRP00739 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPRP00739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPRP00739 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPRP00739 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPRP00739 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HPRP00739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPRP00739 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPRP00739 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPRP00739 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HPRP00739 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPRP00739 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPRP00739 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPRP00739 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPRP00739 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPRP00739 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPRP00739 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HPRP00739 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPRP00739 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPRP00739 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPRP00739 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPRP00739 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPRP00739 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPRP00739 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPRP00739 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPRP00739 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPRP00739 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPRP00739 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPRP00739 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPRP00739 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPRP00739 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPRP00739 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPRP00739 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPRP00739 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPRP00739 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPRP00739 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPRP00739 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPRP00739 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPRP00739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPRP00739 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPRP00739 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPRP00739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPRP00739 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPRP00739 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPRP00739 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPRP00739 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPRP00739 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPRP00739 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPRP00739 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPRP00739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPRP00739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPRP00739 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPRP00739 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPRP00739 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPRP00739 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPRP00739 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPRP00739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPRP00739 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms