Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX7O95931 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX7O95931 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX7O95931 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX7O95931 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX7O95931 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX7O95931 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX7O95931 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX7O95931 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX7O95931 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX7O95931 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX7O95931 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX7O95931 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX7O95931 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX7O95931 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX7O95931 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX7O95931 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX7O95931 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX7O95931 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX7O95931 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX7O95931 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX7O95931 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX7O95931 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX7O95931 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX7O95931 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX7O95931 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX7O95931 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX7O95931 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX7O95931 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX7O95931 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX7O95931 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms