Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAMO95727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAMO95727 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAMO95727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms