Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31AO94979 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31AO94979 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC31AO94979 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31AO94979 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31AO94979 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31AO94979 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms