Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP72O76094 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRP72O76094 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRP72O76094 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP72O76094 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP72O76094 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP72O76094 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRP72O76094 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP72O76094 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP72O76094 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP72O76094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP72O76094 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP72O76094 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP72O76094 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP72O76094 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP72O76094 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP72O76094 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP72O76094 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP72O76094 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP72O76094 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP72O76094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP72O76094 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP72O76094 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP72O76094 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP72O76094 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP72O76094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP72O76094 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP72O76094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP72O76094 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP72O76094 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP72O76094 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP72O76094 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP72O76094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP72O76094 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP72O76094 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP72O76094 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRP72O76094 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRP72O76094 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRP72O76094 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRP72O76094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms