Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT34O76011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT34O76011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT34O76011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT34O76011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT34O76011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT34O76011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT34O76011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT34O76011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT34O76011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT34O76011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT34O76011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT34O76011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT34O76011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT34O76011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT34O76011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT34O76011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT34O76011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT34O76011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT34O76011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT34O76011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT34O76011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT34O76011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT34O76011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT34O76011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT34O76011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT34O76011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT34O76011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT34O76011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT34O76011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT34O76011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT34O76011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT34O76011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT34O76011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT34O76011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT34O76011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT34O76011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT34O76011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT34O76011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT34O76011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT34O76011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT34O76011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT34O76011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT34O76011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT34O76011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT34O76011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT34O76011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT34O76011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT34O76011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT34O76011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT34O76011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT34O76011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT34O76011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT34O76011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT34O76011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT34O76011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT34O76011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT34O76011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT34O76011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT34O76011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT34O76011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms