Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF3O75054 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF3O75054 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF3O75054 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF3O75054 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF3O75054 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF3O75054 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms