Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3O43889 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3O43889 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3O43889 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3O43889 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3O43889 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3O43889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3O43889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3O43889 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3O43889 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CREB3O43889 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CREB3O43889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB3O43889 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3O43889 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3O43889 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3O43889 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3O43889 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB3O43889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB3O43889 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB3O43889 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB3O43889 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3O43889 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3O43889 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3O43889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3O43889 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB3O43889 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3O43889 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3O43889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB3O43889 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3O43889 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB3O43889 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB3O43889 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3O43889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3O43889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3O43889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3O43889 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB3O43889 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB3O43889 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB3O43889 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB3O43889 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB3O43889 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3O43889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3O43889 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3O43889 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3O43889 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB3O43889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB3O43889 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms