Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASA4O43374 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASA4O43374 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASA4O43374 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASA4O43374 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASA4O43374 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASA4O43374 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASA4O43374 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASA4O43374 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASA4O43374 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASA4O43374 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASA4O43374 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASA4O43374 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASA4O43374 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASA4O43374 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASA4O43374 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASA4O43374 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASA4O43374 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASA4O43374 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASA4O43374 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RASA4O43374 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASA4O43374 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASA4O43374 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASA4O43374 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASA4O43374 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASA4O43374 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASA4O43374 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RASA4O43374 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RASA4O43374 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASA4O43374 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASA4O43374 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASA4O43374 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASA4O43374 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASA4O43374 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASA4O43374 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASA4O43374 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASA4O43374 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASA4O43374 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASA4O43374 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASA4O43374 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RASA4O43374 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASA4O43374 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASA4O43374 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASA4O43374 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RASA4O43374 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASA4O43374 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASA4O43374 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RASA4O43374 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASA4O43374 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASA4O43374 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASA4O43374 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASA4O43374 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASA4O43374 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASA4O43374 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASA4O43374 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASA4O43374 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASA4O43374 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASA4O43374 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASA4O43374 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASA4O43374 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASA4O43374 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASA4O43374 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASA4O43374 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASA4O43374 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASA4O43374 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASA4O43374 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASA4O43374 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASA4O43374 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASA4O43374 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASA4O43374 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASA4O43374 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASA4O43374 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASA4O43374 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms