Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A4O43246 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC7A4O43246 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC7A4O43246 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms