Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSC2O15499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSC2O15499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSC2O15499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSC2O15499 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSC2O15499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSC2O15499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSC2O15499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSC2O15499 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSC2O15499 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSC2O15499 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSC2O15499 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSC2O15499 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSC2O15499 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSC2O15499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSC2O15499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSC2O15499 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSC2O15499 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GSC2O15499 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSC2O15499 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSC2O15499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSC2O15499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSC2O15499 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSC2O15499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSC2O15499 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSC2O15499 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSC2O15499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSC2O15499 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSC2O15499 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSC2O15499 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSC2O15499 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSC2O15499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSC2O15499 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSC2O15499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSC2O15499 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSC2O15499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSC2O15499 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSC2O15499 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSC2O15499 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSC2O15499 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSC2O15499 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSC2O15499 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSC2O15499 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSC2O15499 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSC2O15499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 687.4 ms