Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBDO15205 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBDO15205 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBDO15205 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBDO15205 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBDO15205 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBDO15205 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBDO15205 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBDO15205 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBDO15205 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBDO15205 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBDO15205 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBDO15205 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBDO15205 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBDO15205 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBDO15205 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBDO15205 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBDO15205 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBDO15205 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBDO15205 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBDO15205 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBDO15205 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBDO15205 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBDO15205 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBDO15205 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBDO15205 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBDO15205 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBDO15205 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBDO15205 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBDO15205 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBDO15205 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBDO15205 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBDO15205 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBDO15205 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBDO15205 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBDO15205 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBDO15205 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBDO15205 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBDO15205 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBDO15205 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBDO15205 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBDO15205 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBDO15205 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBDO15205 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBDO15205 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBDO15205 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBDO15205 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBDO15205 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBDO15205 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBDO15205 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBDO15205 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBDO15205 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBDO15205 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBDO15205 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBDO15205 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBDO15205 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBDO15205 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBDO15205 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBDO15205 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBDO15205 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBDO15205 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBDO15205 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBDO15205 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBDO15205 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBDO15205 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBDO15205 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBDO15205 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBDO15205 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms