Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WWP2O00308 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WWP2O00308 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WWP2O00308 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WWP2O00308 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WWP2O00308 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WWP2O00308 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WWP2O00308 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WWP2O00308 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WWP2O00308 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WWP2O00308 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WWP2O00308 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WWP2O00308 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WWP2O00308 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WWP2O00308 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WWP2O00308 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WWP2O00308 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WWP2O00308 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WWP2O00308 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WWP2O00308 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WWP2O00308 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WWP2O00308 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WWP2O00308 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WWP2O00308 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WWP2O00308 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WWP2O00308 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WWP2O00308 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WWP2O00308 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WWP2O00308 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WWP2O00308 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WWP2O00308 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WWP2O00308 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WWP2O00308 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WWP2O00308 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WWP2O00308 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WWP2O00308 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WWP2O00308 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WWP2O00308 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WWP2O00308 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WWP2O00308 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WWP2O00308 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WWP2O00308 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WWP2O00308 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WWP2O00308 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WWP2O00308 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WWP2O00308 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WWP2O00308 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms