Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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