Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H7C417 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C417 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C417 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C417 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C417 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C417 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C417 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C417 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C417 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C417 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C417 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C417 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C417 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C417 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C417 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C417 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C417 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C417 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C417 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C417 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C417 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C417 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C417 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H7C417 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H7C417 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H7C417 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H7C417 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
H7C417 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H7C417 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H7C417 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C417 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C417 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H7C417 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C417 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C417 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C417 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H7C417 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C417 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H7C417 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H7C417 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C417 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C417 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H7C417 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms