Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROB1E7EW31 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROB1E7EW31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROB1E7EW31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms