Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC26A0AVF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC26A0AVF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC26A0AVF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms