Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPAARA0A1B0GVQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms