Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms