Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ARXQ96QS3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms