Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms