Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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EFNB3Q15768 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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