Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SMARCA2-230ENST00000634925 1582 ntTSL 510.46□□□□□ -0.747e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.97e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMARCA2-245ENST00000635688 616 ntTSL 38.74□□□□□ -1.017e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SCAF11-211ENST00000547950 697 ntTSL 27.12□□□□□ -1.277e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMARCA2-264ENST00000637856 100 ntTSL 56.25□□□□□ -1.417e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMARCA2-241ENST00000635397 578 ntTSL 45.96□□□□□ -1.467e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.77e-10■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CCT5-207ENST00000509846 546 ntTSL 28.47□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 512.66□□□□□ -0.385e-13■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 210.17□□□□□ -0.785e-13■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 58.57□□□□□ -1.045e-13■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PCBP2-211ENST00000547987 681 ntTSL 38.41□□□□□ -1.065e-13■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 KMT5A-207ENST00000478781 725 ntTSL 529.58■■■□□ 2.334e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.943e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.673e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-206ENST00000505555 2230 ntTSL 218.55■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-205ENST00000504824 1430 ntTSL 518.45■□□□□ 0.543e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.293e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-202ENST00000411704 564 ntTSL 516.53■□□□□ 0.243e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 216.24■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.013e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-205ENST00000428425 2220 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.313e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 NCBP2-212ENST00000479647 552 ntTSL 312.74□□□□□ -0.373e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-11■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 NCBP2-209ENST00000463783 4161 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.133e-11■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 54.71□□□□□ -1.667e-16■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 PPP1R7-211ENST00000438799 976 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.062e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PPP1R7-220ENST00000498170 561 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 RPL30-208ENST00000521112 573 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.135e-31■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SEM1-208ENST00000476463 427 ntTSL 312.02□□□□□ -0.493e-22■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SUPT6H-211ENST00000584312 483 ntTSL 26.41□□□□□ -1.381e-25■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 VAPA-203ENST00000577539 3760 nt5.05□□□□□ -1.63e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.612e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 57.74□□□□□ -1.172e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-13■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.382e-13■□□□□ 8.6
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PUM1Q14671 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.331e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.691e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 SLC38A2-210ENST00000551405 526 ntTSL 418.86■□□□□ 0.611e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-205ENST00000596494 439 ntTSL 318.08■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 317.75■□□□□ 0.431e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 217.25■□□□□ 0.351e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 DOT1L-209ENST00000608122 576 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 316.28■□□□□ 0.21e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 SLC38A2-213ENST00000553252 846 ntTSL 216.18■□□□□ 0.181e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 NDE1-203ENST00000570727 588 ntTSL 415.95■□□□□ 0.141e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-8■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 DDX23-211ENST00000551468 567 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-12■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 DDX23-213ENST00000552369 603 ntTSL 415.34■□□□□ 0.052e-12■□□□□ 8.6
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