Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms