Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASP1P29466 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASP1P29466 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP1P29466 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms