Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD8AP01732 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8AP01732 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD8AP01732 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD8AP01732 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8AP01732 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms