Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms