Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCGF3Q3KNV8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms