Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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GABRA6Q16445 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA6Q16445 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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