Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SYCP1Q15431 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SYCP1Q15431 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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