Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms