Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms