Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTB1Q13884 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms