Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSLNQ13421 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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