Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 DNAJB6-215ENST00000486247 664 ntTSL 47.51□□□□□ -1.212e-8■■■□□ 17.8
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TARDBPQ13148 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-9■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-9■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 SPG21-208ENST00000558943 544 ntTSL 45.13□□□□□ -1.592e-9■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 SPG21-212ENST00000560878 541 ntTSL 54.72□□□□□ -1.652e-9■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 34.05□□□□□ -1.769e-8■■■□□ 17.8
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TARDBPQ13148 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-18■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-18■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 CBL-202ENST00000634301 340 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-18■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.831e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.51e-12■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 NPHP4-206ENST00000468253 781 ntTSL 219.66■□□□□ 0.744e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 MCU-207ENST00000604152 556 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.24□□□□□ -2.055e-7■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.165e-7■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.55e-7■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 45.5□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 318.13■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.7
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TARDBPQ13148 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 414.37□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 17.7
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TARDBPQ13148 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.812e-6■■■□□ 17.7
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TARDBPQ13148 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.224e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.124e-6■■■□□ 17.7
TARDBPQ13148 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-6■■■□□ 17.7
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TARDBPQ13148 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 38.95□□□□□ -0.984e-6■■■□□ 17.7
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TARDBPQ13148 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 17.6
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TARDBPQ13148 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.345e-9■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 213.97□□□□□ -0.175e-9■■■□□ 17.6
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TARDBPQ13148 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 223.29■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 17.6
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TARDBPQ13148 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.156e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 515.71■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-205ENST00000438549 631 ntTSL 515.61■□□□□ 0.096e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 AGAP1-210ENST00000466575 541 ntTSL 314.94□□□□□ -0.023e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-10■■■□□ 17.6
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TARDBPQ13148 DSN1-208ENST00000473615 2075 ntTSL 211.6□□□□□ -0.556e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-209ENST00000480153 2447 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.666e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 DSN1-202ENST00000373740 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.826e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.61□□□□□ -0.873e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.166e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.276e-7■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.376e-10■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 26.25□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 TMEM135-208ENST00000531800 201 ntTSL 53.5□□□□□ -1.851e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.029e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.069e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.119e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 410.75□□□□□ -0.699e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.829e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.839e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.949e-8■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)25.78■■□□□ 1.722e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SRSF11-211ENST00000473950 796 ntTSL 523.91■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SRSF11-212ENST00000475204 760 ntTSL 522.7■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 17.6
TARDBPQ13148 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 218.02■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.6
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