Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRG1Q02297 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms