Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPAP53621 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COPAP53621 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms