Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJC1P36383 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJC1P36383 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJC1P36383 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJC1P36383 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GJC1P36383 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJC1P36383 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms